Η Νέσσος Πληροφορική έχει αναπτύξει σημαντικές εφαρμογές συστημάτων λογισμικού. Στο πελατολόγιο της εταιρείας περιλαμβάνονται :

Microsoft Hellas
Συμμετοχή σε έργα που υλοποιεί η Microsoft Hellas στις Τράπεζες Πειραιώς & ALPHA.

ΑΚΤΩΡ Α.Τ.Ε
Access Control System,
Advanced Toll Lane Application using DSRC Technology

Ίδρυμα Μείζονος Ελληνισμού Ι.Μ.Ε
Μεγάλη Δικτυακή Εγκυκλοπαίδεια Ελληνικού Πολιτισμού (http://www.ehw.gr) 
Ιστορικός Γεωγραφικός Άτλαντας Μειζονος Ελληνισμού  (http://www.ehw.gr) 
Διαχείριση ψηφιακής πολυμεσικής βιβλιοθηκης και δικαιωμάτων κτήσης / χρήσης

Δήμος Αθηναίων
Γεωγραφικό Πληροφοριακό Σύστημα
Μελέτη λειτουργικών και τεχνικών προδιαγραφών για το ΟΠΣ

Δήμος Ιωαννιτών
Μελέτη αναγκών χρηστών για το σύστημα διαχείρισης διεργασιών και εννοιολογικής ανάκτησης πληροφορίας διοίκησης ΕΝΝΟΙΑ.

Δήμος Λαμιέων
Γεωγραφικό Πληροφοριακό Σύστημα

Δήμος Αιγίου
Γεωγραφικό Πληροφοριακό Σύστημα

Δήμος Ιεράπετρας
Γεωγραφικό Πληροφοριακό Σύστημα

Ινστιτούτο Τοπικής Αυτοδιοίκησης (ΙΤΑ)
Συγγραφή μαθημάτων ηλεκτρονικής μάθησης για τα Γεωγραφικά Πληροφοριακά Συστήματα

Υπουργείο Εθνικής Παιδείας
ΟΠΣ για το Γραφείο Κοινωνίας της Πληροφορίας του ΥΠΕΠΘ

Υπουργείο Εσωτερικών
Μελέτη Μοντελοποίησης διαδικασιών για λογαριασμό της Γενικής Γραμματείας Ισότητας
Μελέτη για πιλοτικές εφαρμογές electronic voting και δημόσιας διαβούλευσης μέσω internet

Ελληνική Αεροπορική Βιομηχανία Α.Ε.
Money free system payments in
Restaurants systems

ΙΚΥ
Έργο Τεχνικού Συμβούλου

ΙΔΕΚΕ
Σύστημα δημιουργίας και διαχείρισης ηλεκτρονικών βιβλίων

Υπουργείο Ανάπτυξης
Σύστημα Διαχείρισης Πιστώσεων
Τακτικού Προϋπολογισμού

ID Systems AEBE-
Όμιλος Επιχειρήσεων Δ.Αγγελόπουλος.
Εφαρμογή διαχείρισης έξυπνων καρτών

Pioneer Hellas
Εξειδικευμένο Σύστημα διαχείρισης Πελατών με χρήση Έξυπνης κάρτας

ΕΥΔΑΠ Α.Ε.
Χρηματοοικονομικά Συστήματα-Εφαρμογή Διαχείρισης Τεχνικών Δελτίων

ΕΥΔΑΠ ΠΑΓΙΩΝ
Τεχνικές Εφαρμογές

ΕΛΤΑ Ελληνικά Ταχυδρομεία
Συντήρηση Συστήματοε Παρακολούθησης Περισυλλογών

Ιαπετός Α.Ε. Εταιρεία Συμβούλων
Web based εφαρμογές

Pantec Ο.Ε.
Εφαρμογή Διαχείρισης Εγγράφων

Management Force Ο.Ε.
Τεχνικές Εφαρμογές